Gegründet wurde die Destillerie im Jahre 1997 von Trey Zoeller und seinem Vater Chet, einem berühmten Bourbon-Historiker. Damit führten sie eine Familientradition weiter. Denn bereits im Jahre 1799 stellte man in der Familie Zoeller Whisky her, wenn auch nicht ganz legal: Angeblich wurde ein Familienmitglied damals wegen "Produktion und Vertrieb von Spirituosen" verhaftet. Der Name ist eine Hommage an den ehemaligen Präsidenten Thomas Jefferson, der für seine Neugier und seinen Experimentiergeist bekannt war. Der Jefferson's Bourbon ist die bekannteste Standardabfüllung der amerikanischen Brennerei. Er besteht aus einem Mashbill von 60% Mais, 30% Roggen und 10% Geste und reift für sechs bis zehn Jahre lang in leicht ausgebrannten, amerikanischen Weisseichenfässern heran. Die Bezeichnung "Very Small Batch" trägt er, da jedes Batch aus nur wenigen Fässern (am wahrscheinlichsten acht Fässer) verschnitten wird.